Подразделения в организационной структуре университета , полностью или частично нацелены на обслуживание научно-исследовательской и инновационной деятельности (Научно-исследовательское управление (НИУ) университета, Центр трансфера технологий «ТранспТехнология», Патентно-информационный отдел, Международный отдел);
36 научно-исследовательских и внедренческих лабораторий, входящих в структуру вуза, на базе которых выполняются научные исследования:
- Учебно-научная лаборатория "Инженерная и промышленная экология"
- Учебно-научная лаборатория "Гидравлики и Инженерной гидрологии"
- Учебно-научная лаборатория "Инженерно-геологическая лаборатория"
- Учебно-научная лаборатория "Инженерная экология и химия"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория материаловедения"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория термической обработки металлов"
- Научная лаборатория "Композиционные материалы"
- Научная лаборатория исследования проблем на транспорте, ассоциация автомобильных инженеров (ААИ) - региональное отделение НОЦ "СибАДИ-Минпром"
- Учебно-научная лаборатория "Грунтовый канал"
- Учебная и научно-исследовательская лаборатория "Исследование рабочих процессов бензиновых двигателей"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория технического обслуживания и диагностики автомобилей"
- Научно-исследовательская лаборатория "Лаборатория исследования шин"
- Учебно-научная лаборатория "Малая теплоэнергетика на базе ДВС"
- Учебно-научная лаборатория "Испытание дизельных двигателей"
- Учебно-научная лаборатория "Испытания бензиновых двигателей"
- Учебно-научная лаборатория 'Теплотехника"
- Учебно-научная лаборатория "Эксплуатационные материалы"
- Учебно-научная лаборатория 'Топливная аппаратура"
- Учебно-научная лаборатория "Автоматизированные системы управления дорожным движением"
- Учебно-научно-исследовательская по кафедре "Автоматизация производственных процессов и электротехника"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория минеральных вяжущих и поризованных бетонов"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория механоактивационных и наноструктурных технологий и природных искусственных материалов"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория тяжелых и специальных бетонов"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория органических вяжущих веществ и полимерасфальтобетонов"
- Учебно-научная лаборатория "Лаборатория светотехнических измерений"
- Учебно-научная лаборатория "Автоматизированное проектирование транспортных сооружений"
- Учебно-научная лаборатория "Проектное управление в строительстве"
- Учебно-научная лаборатория аналогового моделирования
- Учебно-научная лаборатория "Физика среды и ограждающие конструкции"
- Учебно-научная лаборатория "Определение транспортно-эксплуатационных показателей дорожных конструкций при строительстве и эксплуатации автомобильных дорог"
- Учебно-научная лаборатория "Контроль качества строительства дорожной одежды"
- Учебно-научная лаборатория "Контроль качества строительства земляного полотна"
- Научная лаборатория "Строительные конструкции"
- Научно-учебная лаборатория "Дорожный Инновационный Центр" (ДИЦ)
- Научно-исследовательская лаборатория "Мосты"
- Учебно-научная лаборатория "Диагностика строительно-дорожных и коммунальных машин"